盐城环保科技城建有国家工程研究中心2个、国家企业技术中心2个，并与清华大学、南京大学、中国科学院、美国明尼苏达大学、澳大利亚墨尔本大学等国内外知名科研院所合作成立了16家新型研发机构，其中省列统新型研发机构9家，占盐城全市的一半，拥有4个拥有CMA/CNAS认证的实验室，提供环保领域检验检测项目近千项。园区科研机构先后荣获国家科技进步一等奖1项、二等奖3项，教育部科技进步特等奖1项，生态环境部科学技术一等奖1项，科技研发能力苏北领先。